Acuigen, xenética para a acuicultura e para a conservación de recursos biolóxicos

Intereses

Son un xenetista interesado no estudo da evolución e a arquitectura dos xenomas, e nas súas aplicacións na xenética da conservación e mellora xenética. Traballei en distintos tipos de marcadores e metodoloxías estatísticas para estimar a estrutura xenética e parámetros poboacionais, así como para a reconstrución filoxenética. Asemade, estou activamente implicado na aplicación de ferramentas de trazabilidade xenealóxica e xenómica en programas de selección. A miña investigación centrouse en organismos acuáticos, peixes ao principio, pero máis recentemente moluscos. Estou interesado na transferencia tecnolóxica a empresas e administracións relacionadas coa xenética da conservación e a selección xenética. Dende o 2003, traballo no desenvolvemento de ferramentas xenómicas para estudos evolutivos e aplicados, como mapas xenéticos para a identificación de QTL, estudos de expresión xénica masiva (oligo-microarrais, RNAseq) para identificar xenes candidatos relacionados con caracteres produtivos, e xenotipado de SNPs a gran escala (RADseq) en proxectos de xenómica poboacional ou de selección xenómica. Recentemente, o noso grupo coliderou a secuenciación completa do xenoma do rodaballo.

Escolma de publicacións

Figueras A., Robledo D., Corvelo A., Hermida M., Pereiro P., Rubiolo J. A., Gómez-Garrido J., Carreté L., Bello X., Gut M., Gut I.G., Marcet-Houben M., Forn-Cuní G., Galán B., García J.L., Abal-Fabeiro J.L., Pardo B.G., Taboada X., Fernández C., Vlasova A., Hermoso-Pulido A., Guigo R., Alvarez-Dios J. A., Gómez-Tato A., Viñas A., Maside X., Gabaldón T., Novoa B., Bouza C., Alioto T. & Martínez P. 2016. Whole genome sequencing of turbot (Scophthalmus maximus; Pleuronectiformes): a fish adapted to demersal life. DNA Research (doi: 10.1093/dnares/dsw007)

Pino-Querido A., Alvarez-Castro J.M., Guerra-Varela J., Toro M.A., Vera M., Pardo B.G., Fuentes J., Blanco J. & Martínez P. 2015. Heritability estimation for okadaic acid algal toxin accumulation, mantle color and growth traits in Mediterranean mussel (Mytilus galloprovincialis). Aquaculture 440: 32-39.

Taboada X.,Hermida M., Pardo B.G., Viñas A., Bouza C. & Martínez P. 2014. Fine mapping and evolution of the major sex determining region in turbot (Scophthalmus maximus). G3, Gene, Genomes, Genetics 10: 1871-1880.

Robledo, D., Ronza P., Harrison P., Losada A. P., Bermúdez R., Pardo B.G., Redondo M. J., Sitjá-Bobadilla A., Quiroga M. I. & Martínez, P. 2014. RNA-seq analysis reveals significant transcriptome changes in turbot (Scophthalmus maximus) suffering severe enteromyxosis. BMC Genomics 15:1149.

Ribas L., Pardo B.G., Fernández C., Alvarez-Dios J.A., Gómez-Tato A., Quiroga M.I., Planas J., Sitjà-Bobadilla A., Martínez P. & Piferrer F. 2013. A combined strategy involving Sanger and 454 pyrosequencing increases genomic resources to aid in the management of reproduction, disease control and genetic selection in the turbot (Scophthalmus maximus). BMC Genomics 14:180.

Bouza C., Hermida M, Pardo B.G., Vera M., Fernández C., de la Herrán R., Navajas R., Álvarez-Dios J.A., Gómez-Tato A. & Martínez P. 2012. An Expressed Sequence Tag (EST)-enriched genetic map of turbot (Scophthalmus maximus): a useful framework for comparative genomics across model and farmed teleosts. BMC Genetics 13: 54.

Rodríguez-Ramilo S., Toro M.A., Bouza C., Hermida M., Pardo B.G., Cabaleiro S. & Martínez P. 2011. QTL detection for Aeromonas salmonicida resistance related traits in turbot (Scophthalmus maximus). BMC Genomics 12:541.

Sánchez-Molano E., Cerna A., Toro M.A., Bouza C., Hermida M., Pardo B.G., Cabaleiro S., Fernández J. & Martínez P. 2011. Detection of growth-related QTL in turbot (Scophthalmus maximus). BMC Genomics 12: 473.

Millán A., Gómez-Tato A., Fernández C., Pardo B.G., Álvarez-Dios J.A., Calaza M., Bouza C., Vázquez M., Cabaleiro S. & Martínez P. 2010. Design and performance of a turbot (Scophthalmus maximus) oligo-microarray based on ESTs from immune tissues. Marine Biotechnology 12: 452-465.

Martínez P., Bouza C., Hermida M., Fernández J., Toro M.A., Vera M., Pardo B.G., Millán A., Fernández C., Vilas R., Viñas A., Sánchez L., Felip A., Piferrer F., Ferreiro I. & Cabaleiro S. 2009. Identification of the major sex-determining region of turbot (Scophthalmus maximus). Genetics 183: 1443-1452

Bouza C., Hermida M., Pardo B.G., Fernández C.,  Castro J., Fortes G., Sánchez L., Presa P., Pérez M., Sanjuán A., Comesaña S., Álvarez J.A., Calaza M., Cal R., Piferrer F. y Martínez P. 2007. A microsatellite genetic map in the turbot (Scophthalmus maximus). Genetics 177: 2457-2467.