Acuigen, genética para la acuicultura y para la conservación de recursos biológicos

Intereses

Soy un genetista interesado en el estudio de la evolución y la arquitectura de los genomas, y en sus aplicaciones en la genética de la conservación y mejora genética. He trabajado con distintos tipos de marcadores y metodologías estadísticas para estimar la estructura genética y parámetros poblacionales, así como para la reconstrucción filogenética. Asimismo, estoy activamente implicado en la aplicación de herramientas de trazabilidad genealógica y genómicas en programas de selección. Mi investigación se ha centrado en organismos acuáticos, inicialmente peces, pero más recientemente moluscos. Estoy interesado en la transferencia tecnológica a empresas y administración relacionadas con la genética de la conservación y la selección genética. Desde 2003, trabajo en el desarrollo de herramientas genómicas para estudios evolutivos y aplicados, tales como mapas genéticos para la identificación de QTL, estudios de expresión génica masiva (oligo-microarrays, RNAseq) para identificar genes candidatos relacionados con caracteres productivos, y genotipado de SNPs a gran escala (RADseq) en proyectos de genómica poblacional o de selección genómica. Recientemente, nuestro grupo ha coliderado la secuenciación completa del genoma de rodaballo.

Publicaciones seleccionadas

Figueras A., Robledo D., Corvelo A., Hermida M., Pereiro P., Rubiolo J. A., Gómez-Garrido J., Carreté L., Bello X., Gut M., Gut I.G., Marcet-Houben M., Forn-Cuní G., Galán B., García J.L., Abal-Fabeiro J.L., Pardo B.G., Taboada X., Fernández C., Vlasova A., Hermoso-Pulido A., Guigo R., Alvarez-Dios J. A., Gómez-Tato A., Viñas A., Maside X., Gabaldón T., Novoa B., Bouza C., Alioto T. & Martínez P. 2016. Whole genome sequencing of turbot (Scophthalmus maximus; Pleuronectiformes): a fish adapted to demersal life. DNA Research (doi: 10.1093/dnares/dsw007)

Pino-Querido A., Alvarez-Castro J.M., Guerra-Varela J., Toro M.A., Vera M., Pardo B.G., Fuentes J., Blanco J. & Martínez P. 2015. Heritability estimation for okadaic acid algal toxin accumulation, mantle color and growth traits in Mediterranean mussel (Mytilus galloprovincialis). Aquaculture 440: 32-39.

Taboada X.,Hermida M., Pardo B.G., Viñas A., Bouza C. & Martínez P. 2014. Fine mapping and evolution of the major sex determining region in turbot (Scophthalmus maximus). G3, Gene, Genomes, Genetics 10: 1871-1880.

Robledo, D., Ronza P., Harrison P., Losada A. P., Bermúdez R., Pardo B.G., Redondo M. J., Sitjá-Bobadilla A., Quiroga M. I. & Martínez, P. 2014. RNA-seq analysis reveals significant transcriptome changes in turbot (Scophthalmus maximus) suffering severe enteromyxosis. BMC Genomics 15:1149.

Ribas L., Pardo B.G., Fernández C., Alvarez-Dios J.A., Gómez-Tato A., Quiroga M.I., Planas J., Sitjà-Bobadilla A., Martínez P. & Piferrer F. 2013. A combined strategy involving Sanger and 454 pyrosequencing increases genomic resources to aid in the management of reproduction, disease control and genetic selection in the turbot (Scophthalmus maximus). BMC Genomics 14:180.

Bouza C., Hermida M, Pardo B.G., Vera M., Fernández C., de la Herrán R., Navajas R., Álvarez-Dios J.A., Gómez-Tato A. & Martínez P. 2012. An Expressed Sequence Tag (EST)-enriched genetic map of turbot (Scophthalmus maximus): a useful framework for comparative genomics across model and farmed teleosts. BMC Genetics 13: 54.

Rodríguez-Ramilo S., Toro M.A., Bouza C., Hermida M., Pardo B.G., Cabaleiro S. & Martínez P. 2011. QTL detection for Aeromonas salmonicida resistance related traits in turbot (Scophthalmus maximus). BMC Genomics 12:541.

Sánchez-Molano E., Cerna A., Toro M.A., Bouza C., Hermida M., Pardo B.G., Cabaleiro S., Fernández J. & Martínez P. 2011. Detection of growth-related QTL in turbot (Scophthalmus maximus). BMC Genomics 12: 473.

Millán A., Gómez-Tato A., Fernández C., Pardo B.G., Álvarez-Dios J.A., Calaza M., Bouza C., Vázquez M., Cabaleiro S. & Martínez P. 2010. Design and performance of a turbot (Scophthalmus maximus) oligo-microarray based on ESTs from immune tissues. Marine Biotechnology 12: 452-465.

Martínez P., Bouza C., Hermida M., Fernández J., Toro M.A., Vera M., Pardo B.G., Millán A., Fernández C., Vilas R., Viñas A., Sánchez L., Felip A., Piferrer F., Ferreiro I. & Cabaleiro S. 2009. Identification of the major sex-determining region of turbot (Scophthalmus maximus). Genetics 183: 1443-1452

Bouza C., Hermida M., Pardo B.G., Fernández C.,  Castro J., Fortes G., Sánchez L., Presa P., Pérez M., Sanjuán A., Comesaña S., Álvarez J.A., Calaza M., Cal R., Piferrer F. y Martínez P. 2007. A microsatellite genetic map in the turbot (Scophthalmus maximus). Genetics 177: 2457-2467.